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生物處理是利用微生物來吸咐、分解、氧化污水中的有機物，把不穩定的有機物降解為穩定無害的物質，從而使污水得到凈化。現代的生物處理法，按作用微生物的不同，可分好氧氧化和厭氧還原兩大類。前者廣泛用于處理城市污水和有機性工業廢水。好氧氧化應用較廣包含著很多藝種工藝和構筑物。生物膜法（包含生物過濾池、生物轉盤）、生物接觸氧化等多種工藝和構筑物。活性污泥法和生物膜法都是人工生物處理方法。此外還有農田和池塘的天然生物處理法，即灌溉田和生物塘。生物處理成本低廉，因此是目前應用最廣泛的污水處理方法。